Ogromne zasługi dla rozwoju regionu oddali Fuggerowie, ród niemiecki osiadły w Augsburgu od roku 1367. Jego członkowie prowadzili intensywną działalność gospodarczą, byli bankierami ówczesnych papieży oraz cesarzy. Fuggerowie wspierali wiele miejskich kościołów, wznosili budynki, finansowali pomniki, fontanny itp. Na placu Fuggerplatz znajduje się pomnik Hansa Jakuba Fuggera. W pobliżu znajduje się dawne biuro Fuggerów. Zwiedzając miasto, często można natknąć się na ślady rodziny Fugger.
Miasto odegrało dużą rolę podczas reformacji. W czerwcu 1530 roku na sejmie w Augsburgu ogłoszono wyznanie augsburskie (Konfesja augsburska, łac. Confessio Augustana), podstawową księgę wyznaniową luteranizmu. 25 września 1555 roku w Augsburgu zawarto pokój między cesarzem Karolem V a protestanckimi książętami Rzeszy, który kończył drugą wojnę religijną, toczącą się w latach 1552–1555. Na mocy jego postanowień usankcjonowano współistnienie obok siebie katolicyzmu i luteranizmu oraz wprowadzono zasadę cuius regio, eius religio (czyj kraj, tego religia).
Pod koniec drugiej wojny światowej Augsburg został częściowo zniszczony podczas nalotów alianckiego lotnictwa. Miasto było bombardowane ponad dziesięć razy, a celem ataków były zakłady zbrojeniowe, m.in. zakłady Messerschmitt oraz fabryka Maschinenfabrik Augsburg-Nürnberg (MAN). Obecnie miasto jest ważnym ośrodkiem uniwersyteckim i kulturalnym.